À l'origine, la chapelle fut construite pour recueillir les reliques de Saint-Aurélien qui se trouvaient alors dans l'église Saint-Cessateur (disparue, située au bas de l'actuelle rue des Pénitents-Rouges), qui était alors en ruine. Au XVIIe siècle, le chœur fut agrandi et décoré dans le style baroque. À la Révolution française, la chapelle fut vendue comme bien national et achetée par un membre de la confrérie de Saint-Aurélien : cette dernière en est toujours la propriétaire. La chapelle est encore un lieu de culte important pour les habitants du quartier de la Boucherie et les membres de la confrérie.
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groupe sculpté (petite nature) : sainte Anne, la Vierge et l'Enfant ou sainte Anne trinitaire, dite l'Enfant au rognon
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statue (petite nature) : saint Roch
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statue (petite nature) : Sainte Catherine d'Alexandrie
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buste-reliquaire : saint Aurélien
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châsse dite de saint Aurélien
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2 panonceaux de cierge de la confrérie de pénitents feuille morte : sainte Madeleine pénitente
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2 panonceaux de cierge de la confrérie de saint Aurélien : insignes épiscopaux
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2 panonceaux de cierge de la confrérie de saint Aurélien : le Saint Sacrement
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bâton de procession de la confrérie de saint Aurélien (bâton funéraire)
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2 panonceaux de cierge de la confrérie de saint Aurélien : saint Aurélien
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6 bâtons de procession de la confrérie de pénitents feuille morte : sainte Madeleine pénitente
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4 insignes (2 paires de panonceaux) de la confrérie de saint Aurélien : saint Martial, saint Aurélien
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chasuble, étole, manipule (ornement blanc)
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chasuble, étole, manipule, voile de calice (ornement blanc)
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chandelier d'autel
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devant d'autel de la confrérie de pénitents feuille morte : sainte Madeleine pénitente
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croix de procession de la confrérie de pénitents feuille morte
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2 panonceaux de cierge de la confrérie de pénitents feuille morte : sainte Madeleine pénitente